L'histoire prend place sur l'île japonaise de Shikoku à l'ère des dieux. Yûna, Mimori, Fû et Itsuki sont membres du club des héros (讃州中学勇者部, Sanshū Chūgaku Yūsha-bu^?), où elles donnent de leur personne pour aider ceux dans le besoin. Lors d'un jour comme un autre, les membres du club sont soudainement pris dans une explosion de lumière et transportés dans une étrange forêt où elles rencontrent de mystérieux monstres, connus sous le nom de Vertex, qui cherchent à détruire le Shinju (神樹^?, « Divine Tree »), la déité gardienne protégeant et bénissant l'humanité. En utilisant une application spéciale sur leur téléphone, accordé par le Shinju lui-même, Yûna et ses amies doivent se changer en « héroïne » avec pouvoirs magiques afin de sauver le monde de la destruction imminente.

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